Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCL27Q9Y4X3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCL27Q9Y4X3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCL27Q9Y4X3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CCL27Q9Y4X3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CCL27Q9Y4X3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL27Q9Y4X3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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