Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms