Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms