Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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