Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms