Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPMQ9NSP4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPMQ9NSP4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms