Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms