Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms