Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C11orf49Q9H6J7 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms