Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms