Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms