Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM4Q9BWF3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms