Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms