Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms