Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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