Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGR3Q8TD06 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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