Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC148Q8NFR7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms