Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms