Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN4Q8IWV2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms