Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms