Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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