Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms