Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms