Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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C10orf55Q5SWW7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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C10orf55Q5SWW7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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C10orf55Q5SWW7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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C10orf55Q5SWW7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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