Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms