Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPL39P5Q59GN2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms