Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms