Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms