Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms