Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HIF1AQ16665 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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