Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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