Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC37Q16543 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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