Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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