Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms