Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms