Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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