Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms