Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms