Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms