Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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