Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms