Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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