Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms