Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms