Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC3AQ02505 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms