Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms