Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG7P83436 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms