Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms