Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms