Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms